يعد مجلس المنظمة أحد الأدوات القانونية التي تنظم عمل المنظمة ويتكون من الوزراء المسؤولين عن البيئة في الدول الأعضاء.
اجتماعات المجلس
تُعقد اجتماعات المجلس وفقًا للفقرة (أ) من المادة الثامنة عشرة والفقرة (ب) من المادة الثلاثين.
- ويعقد المجلس اجتماعات عادية مرة واحدة في السنة. ثم قررت اللجنة التنفيذية 4/7 أن يُعقد الاجتماع العادي للمجلس كل عامين، وأقرّ ذلك المجلس السادس للمنظمة في أبريل 1988.
- وتعقد اجتماعات غير عادية للمجلس بناء على طلب يقدم من دولة واحدة على الاقل وتؤيده دولة متعاقدة اخرى كحد أدنى , أو بناء طلب من الامين التنفيذي تؤيده دولتان متعاقدتان على الاقل
- وتعقد اجتماعات المجلس في مقر المنظمة أو في أي مكان آخر يتفق عليه بالتشاور بين الدول المتعاقدة . ويتكون النصاب من ثلاثة ارباع الدول المتعاقدة.
الرئاسة
- تسند رئاسة المجلس لكل دولة متعاقدة بالدور حسب ترتيب اسمائها في اللغة الانجليزية .
- ويشغل الرئيس منصبة لمدة عامين , ولا يجوز له خلال فترة رئاسته أن يعمل ممثلا لدولتة . وفي حالة خلو منصب الرئاسة , تسمى الدولة المتعاقدة التي ترأس المجلس خلفا للرئيس يشغل المنصب لحين انتهاء فترة رئاسة هذه الدولة المتعاقدة.
: تتم اجراءات التصويت في المجلس على النحو التالي
يكون لكل دولة متعاقدة صوت واحد
تتخذ القرارات في شأن الموضوعات الهامة باجماع اصوات الدول المتعاقدة
التي تحضر الاجتماع وتشترك في التصويت
تتخذ القرارات في شأن الامور الاجرائية بأغلبية ثلاثة أرباع الدول المتعاقدة التي تحضر الاجتماع وتشترك في التصويت
مهام المجلس كالاتي
- متابعة النظر في تنفيذ الاتفاقية وبروتوكولاتها وخطة العمل المشار اليها في الفقرة (هـ ) من المادة الاولى
- مراجعة وتقييم حالة التلوث البحري واَثاره في المنطقة البحرية في ضوء التقارير المقدمة من الدول المتعاقده والمنظمات الدولية والاقليمية المختصة
السياسات والقرارات
- اقرار ومراجعة وتعديل ملاحق كل من الاتفاقية وبروتوكولاتها ، حسب الاقتضاء , وفقا للاجراءات الواردة في المادة الحادية والعشرين .
- تسلم ودراسة التقارير التي تقدمها الدول المتعاقدة طبقا للمادتين التاسعة والثالثة والعشرين
- دراسة التقارير التي تعدها الامانة عن المسائل المتعلقة بالاتفاقية وبالشئون المتصلة بادارة المنظمة .
- اصدار التوصيات في شأن اقرار أي بروتوكولات اضافية أو تعديلات للاتفاقية أو بروتوكولاتها وفقا للمادتين التاسعة عشرة والعشرين
إدارة
- انشاء أجهزة فرعية وتشكيل مجموعات عمل خاصة , حسب الاقتضاء , لدراسة اي أمور تتعلق بالاتفاقية وبروتوكولاتها وملاحق كل من الاتفاقية وبروتوكولاتها.
- تعيين امين تنفيذي واتخاذ ما يلزم نحو تمكين الامين التنفيذي من تعيين أفراد اَخرين حسب الاقتضا
- دراسة وتنفيذ أية مهام اضافية قد يتطلبها تحقيق أغراض الاتفاقية وبروتوكولاتها
- متابعة مهام الامانة دوريا

